Инобитек DICOM-Просмотрщик

6.4. Редактирование структуры

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

При работе с сегментированными структурами обращайте внимание на то, какая структура или объём выделен. Все действия по редактированию выполняются с выделенной видимой структурой или объёмом. Если в данный момент флаг "Видимость структуры" (обозначен стрелкой на рис. 6.8) для этой структуры или объёма снят, то редактирование невозможно.



Если в окне МПР открыта объёмная модель (см. раздел 5.16), то изменения структуры одновременно отображается на модели. Это вызывает дополнительную нагрузку на процессор. Если необходимо уменьшить нагрузку, нажмите на стрелку в правой части кнопки "Рост региона" PIC и снимите флаг "Интерактивное обновление 3D". После этого структура на объёмной модели будет обновляться после завершения очередного этапа построения.

Для редактирования структуры используются специализированные инструменты (описаны ниже) и инструменты редактирования объёма:

  • "Полигональное вырезание" (описан в разделе 3.7.1);
  • "Инвертированное полигональное вырезание" (описан в разделе 3.7.2);
  • "Удалить область" (описан в разделе 3.7.3);
  • "Удалить все области за исключением выделенной" (описан в разделе 3.7.4);
  • "Вырезание" (описан в разделе 3.7.6);
  • "Наращивание" (описан в разделе 3.7.6). Использование инструмента возможно, только если часть структуры уже построена;
  • "Рост (дилатация)" (описан в разделе 3.7.7);
  • "Сокращение (эрозия)" (описан в разделе 3.7.7);
  • "Удалить шум (открытие)" (описан в разделе 3.7.7);
  • "Удалить пустоты (закрытие)" (описан в разделе 3.7.7);
  • "Заполнение" (описан в разделе 3.7.7).
  • "Отсечение невидимого объёма" (описан в разделе 3.7.7).
  • "Сегментация дерева сосудов" (описан в разделе 6.4.4).
  • "Объединить" (описан в разделе 6.6);
  • "Вычесть" (описан в разделе 6.6);
  • "Пересечение" (описан в разделе 6.6);

6.4.1 Инструменты для автоматического заполнения структуры

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Инструмент "Сегментация от точки по маске" позволяет строить структуры для связанных областей, то есть участков тканей, не соединённых с другими тканями. Чтобы построить структуру для связанной области, выполните следующие действия:

  1. Активируйте инструмент "Сегментация от точки по маске" PIC левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  2. Щёлкните кнопкой мыши на связанной области. По области будет построена структура.
  3. Если структура построена для большей области, чем требовалось, отмените действие, нажав на кнопку "Отменить" PIC , затем отредактируйте маску и повторите построение.

Если получить связанную область, полностью отделённую от других тканей, невозможно, то при использовании инструмента "Сегментация от точки по маске" возникнут утечки (сегментация за пределами требуемой области). Чтобы быстро и с минимальными утечками сегментировать такую область, используйте инструмент "Рост региона" PIC :

  1. Активируйте инструмент "Рост региона" левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14. Режимы работы инструмента описаны в разделе 6.4.3.
  2. Выберите точку на маске примерно в центре области, которую необходимо сегментировать.
  3. Удерживая нажатой кнопку мыши, перемещайте курсор в любую сторону. Сегментированная структура будет увеличиваться. Рост происходит быстрее в тех направлениях, в которых кривизна поверхности меньше (в тонких участках наращивание происходит медленнее, чтобы избежать утечек). Направление движения курсора не имеет значения, важно расстояние от точки начала движения. При движении курсора в обратном направлении уменьшения построенной структуры не происходит.
  4. Если структура построена полностью или дальнейшее наращивание приведет к утечкам, остановите построение, отпустив левую кнопку мыши.
  5. При необходимости повторите построение для области, которая еще не была сегментирована.
  6. Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC . Инструмент срабатывает через определённые промежутки времени, поэтому одним нажатием на кнопку "Отменить" Вы сможете удалить только ту часть структуры, которая была построена при очередном срабатывании, а не на всём пути движения курсора.

6.4.2 Инструмент "Наращивание"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Чтобы заполнить структуру в окне мультипланарной реконструкции с помощью инструмента "Наращивание", выполните следующие действия:

  1. Активируйте инструмент "Наращивание" PIC левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  2. Установите необходимый диаметр инструмента. Для этого перемещайте курсор мыши вверх и вниз, удерживая нажатой клавишу Alt на клавиатуре.
  3. Переместите курсор мыши в ту область, для которой необходимо создать структуру.
  4. Нажмите на кнопку мыши и отпустие её. Ткани под маской, попавшие внутрь сферы, будут добавлены к структуре. Цвет тканей изменится на тот, который установлен для структуры.
  5. Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC .
  6. Чтобы выделить сразу большой участок тканей, перемещайте инструмент "Наращивание" PIC с нажатой кнопкой мыши. Однако, имейте в виду, что инструмент будет срабатывать через определённые промежутки времени, поэтому одним нажатием на кнопку "Отменить" Вы сможете удалить только ту часть структуры, которая была добавлена при очередном срабатывании, а не на всём пути движения сферы.
  7. Чтобы удалить часть добавленных тканей, нажмите на стрелку в правой части кнопки и выберите инструмент "Вырезание" PIC . Инструмент работает аналогично инструменту "Наращивание", но в отличие от него удаляет выбранные ткани из сегмента.
  8. Чтобы отключить или включить маску, нажмите на кнопку "Редактирование сегментной структуры" PIC .

В окне объёмной реконструкции инструмент используется для наращивания структуры без учета маски. Для наращивания по маске используйте инструмент "Восстановить по маске". Обратите внимание, что для заполнения структуры необходимо, чтобы какой-либо объём (основной или структура) был виден. Установите для него флаг "Видимость структуры" (обозначен стрелкой на рис. 6.16), иначе наращивание другой структуры будет невозможно.



6.4.3 Инструмент "Рост региона"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

При построении структур с помощью инструмента "Наращивание" могут возникать так называемые утечки (сегментация за пределами требуемой области), например, если два органа соединены тонкими перемычками. "Рост региона" учитывает форму и плотность сегментируемых областей и позволяет минимизировать утечки. Инструмент имеет два режима работы: "Метод EDT" и "Метод поверхностей уровня". Чтобы переключить режим, нажмите на стрелку в правой части кнопки PIC и выберите нужный режим. Текущий режим отмечен флагом.

В режиме "Метод EDT" инструмент строит структуру, заполняя пространство, ограниченное маской. Для построения структуры в окне мультипланарной реконструкции методом EDT выполните следующие действия:

  1. Активируйте инструмент "Рост региона" PIC в режиме "Метод EDT" левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  2. Установите курсор примерно в центр области, которую необходимо сегментировать.
  3. Удерживая нажатой кнопку мыши, перемещайте курсор в любую сторону. Сегментированная структура будет увеличиваться. Рост происходит быстрее в тех направлениях, в которых кривизна поверхности меньше (в тонких участках наращивание происходит медленнее, чтобы избежать утечек). Направление движения курсора не имеет значения, важно расстояние от точки начала движения. При движении курсора в обратном направлении уменьшения построенной структуры не происходит.
  4. Если структура построена полностью или дальнейшее наращивание приведет к утечкам, остановите построение, отпустив левую кнопку мыши.
  5. При необходимости повторите построение для области, которая еще не была сегментирована.
  6. Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC . Инструмент срабатывает через определённые промежутки времени, поэтому одним нажатием на кнопку "Отменить" Вы сможете удалить только ту часть структуры, которая была построена при очередном срабатывании, а не на всём пути движения курсора.

В режиме "Метод поверхностей уровня" инструмент использует собственную маску, построенную по специальному алгоритму, поэтому построенная структура может выходить за пределы обычной маски и при изменении её границ будет видна. Для построения структуры в окне мультипланарной реконструкции методом поверхностей уровня выполните следующие действия:

  1. Активируйте инструмент "Рост региона" PIC в режиме "Метод поверхностей уровня" левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  2. Установите курсор примерно в центр области, которую необходимо сегментировать.
  3. Нажмите и удерживайте кнопку мыши. В окне, в котором выполняется построение, появится собственная маска инструмента синего цвета. Если маска плохо видна на фоне основной маски, уменьшите прозрачность основной маски. Для этого нажмите на стрелку в правой части кнопки PIC "Добавить новую сегментированную структуру" и в открывшемся диалоге уменьшите значение "Непрозрачность".
  4. Оцените покрытие тканей синей маской. Плотность тканей, попавших под синюю маску, зависит от плотности под курсором. Если маска построена неправильно, то отпустите левую кнопку, отмените построение, нажав на кнопку "Отменить" PIC или удалив построенную структуру, переместите курсор на участок тканей с нужной плотностью и повторите этот пункт.
  5. Красная окружность вокруг курсора показывает величину кривизны областей, которые будут сегментированы (чем меньше диаметр окружности, тем большая кривизна допускается, то есть более тонкие структуры сегментируются). Чтобы изменить диаметр окружности, перемещайте мышь с нажатой левой кнопкой вверх или вниз, удерживая клавишу Alt на клавиатуре.
  6. Чтобы построить структуру, перемещайте курсор в любую сторону, удерживая нажатой кнопку мыши. Сегментированная структура будет увеличиваться в пределах синей маски. Если синяя маска больше, чем обычная, то построение происходит и за пределами обычной, но результат виден только в её пределах.
  7. Если структура построена полностью или дальнейшее наращивание приведёт к утечкам, остановите построение, отпустив кнопку мыши.
  8. При необходимости повторите построение для области, которая еще не была сегментирована.
  9. Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC . Инструмент срабатывает через определённые промежутки времени, поэтому одним нажатием на кнопку "Отменить" Вы сможете удалить только ту часть структуры, которая была построена при очередном срабатывании, а не на всём пути движения курсора.

В окне объёмной реконструкции инструмент работает аналогично. Обратите внимание, что для заполнения структуры необходимо, чтобы какой-либо объём (основной или структура) был виден. Установите для него флаг "Видимость структуры", иначе наращивание другой структуры будет невозможно.

6.4.4 Инструмент "Сегментация дерева сосудов"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Инструмент предназначен для сегментации сосудов.

Сегментация выполняется только для видимой части структуры (основного объёма). Перед применением инструмента удалите лишние части объёма для ускорения работы инструмента с помощью инструментов вырезания. Для сосудов лёгких используйте команду извлечения области лёгочных сосудов. Для этого нажмите на стрелку в правой части кнопки "Сегментация дерева сосудов" PIC левой кнопкой мыши и выберите команду "Извлечение области лёгочных сосудов". Процесс может занять некоторое время. После извлечения области лёгочных сосудов для объёма устанавливается цветовая таблица "[WL]Высокая интенсивность" (подробнее о цветовых таблицах в разделе 2.17).

Чтобы сегментировать сосуды, выполните следующие действия:

  1. Выделите нужную структуру (основной объём), установите для неё флаг "Видимость структуры".
  2. Нажмите на кнопку "Сегментация дерева сосудов" PIC левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  3. В открывшемся диалоговом окне укажите следующие параметры:
    • Максимальный диаметр сосуда (см). Чем больше этот параметр, тем более толстые сосуды обнаруживаются, однако повышается вероятность ложного распознавания других тканей или группы сосудов как один сосуд. Уменьшение параметра приводит к дроблению дерева на несколько, так как крупные сосуды, объединяющие деревья, исключаются.
    • Количество структур деревьев сосудов. Параметр ограничивает максимальное количество создаваемых структур деревьев сосудов. Структуры создаются для самых крупных деревьев.

После сегментации инструмент остаётся активным для работы с построенными деревьями. На панели сегментации отображаются созданные структуры. Чтобы выделить сосуд, наведите на него курсор мыши. Чтобы выделить сосуд и его поддеревья, наведите на него курсор, удерживая нажатой клавишу Shift на клавиатуре. На рис. 6.10 изображён выделенный сосуд.



Сосуды, которые не относятся ни к одному дереву, считаются некорректными. Чтобы отсоединить сосуд от дерева, не присоединяя его к другим деревьям, его достаточно пометить как некорректный. Для этого наведите курсор на сосуд и дважды кликните кнопкой мыши либо кликните кнопкой один раз, удерживая клавишу Ctrl на клавиатуре. Такой сосуд можно выделить на базовом объёме, удерживая клавишу Alt на клавиатуре, и присоединить к любой структуре.

Присоедининение сосуда к другому дереву выполняется несколькими способами:

  1. Выделите соответствущую этому дереву структуру на панели сегментации, наведите курсор на сосуд так, чтобы он выделился, и кликните один раз кнопкой мыши. Цвет сосуда изменяется на цвет выбранной структуры.
  2. Наведите курсор на сосуд, нажмите на кнопку мыши. Под курсором появляется зелёное перекрестие. Чтобы выбрать дерево, к котором необходимо присоединить сосуд, наведите на него курсор мыши. Сосуд соединяется с деревос зелёной линией. Отпустите, курсор. Сосуд присоединён. Если курсор не наведен ни на одно дерево, выполняется осоединение сосуда. В этом случае сосуд обозначается красным перекрестием.

После того, как инструмент деактивирован, выделение, присоединение и установка отметки некорректности сосуда невозможны. Чтобы продолжить работу с уже построенными деревьями, нажмите на кнопку "Сегментация дерева сосудов" PIC . Появляется диалог с предупреждением "Сосуды уже рассчитаны для этого объёма. Выполнить перерасчёт с использованием маски текущей структуры?", нажмите "Нет" в диалоге.

Чтобы выполнить новую сегментацию сосудов, не удаляя результаты старой, выберите структуру (основной объём), для которого необходимо выполнить действие, нажмите на кнопку "Сегментация дерева сосудов" PIC и в появившемся диалоге нажмите "Да". После этого выделяются сосуды, созданные после последнего применения инструмента.

6.4.5 Инструмент "Сегментация методом водораздела"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Инструмент используется для сегментации объёма методом водораздела и позволяет разбить объём на несколько непересекающихся частей.

Инструмент имеет два режима (направления заполнения бассейнов):

  1. Низкая плотность для разделения мягких тканей, окружённых более плотными: органов, содержащих воздух, мозга. В этом случае заполнение бассейнов происходит от меньшей плотности тканей к большей. Минимальная плотность тканей в этом случае является точкой, с которой начинается заполнение бассейнов, а параметр "Максимальная плотность" ограничивает сверху плотность тканей, подлежащих сегментации.
  2. Высокая плотность для разделения плотных тканей, окружённых менее плотными: костей, контрастированных органов. В этом случае заполнение бассейнов начинается с максимальной плотности и происходит в сторону её уменьшения, а минимальная плотность тканей, подлежащих сегментации, ограничивается снизу параметром "Минимальная плотность".

Для того, чтобы ускорить процесс сегментации и избежать создания лишних сегментов, исключите ненужные ткани из сегментируемого объёма с помощью инструментов вырезания.

Чтобы сегментировать ткани методом водораздела, выполните следующие действия:

  1. Выберите объём, который необходимо сегментировать.
  2. При необходимости обрежьте ткани, которые не нужно сегментировать.
  3. Активируйте инструмент "Сегментация методом водораздела", нажав на кнопку PIC на панели редактирования объёма.
  4. В открывшемся диалоговом окне установите следующие параметры:
    • "Минимальная плотность";
    • "Максимальная плотность";
    • "Минимальная глубина": минимальная глубина объединяемых бассейнов;
    • "Максимальное количество бассейнов": максимальное количество создаваемых структур (максимально 31);
    • Выберите направление ("Низкая плотность" "Высокая плотность");
    • Выберите из выпадающего списка "Источник" структуру, на основе которой необходимо выполнить сегментацию.
    • Чтобы запомнить эту структуру как источник по умолчанию, установите флаг "Запомнить выбранную структуру".
    • Чтобы отключить видимость исходной структуры, установите флаг "Скрыть исходную структуру".
    • Чтобы отключить видимость не изменившихся после выполнения сегментации структур, установите флаг "Скрыть другие структуры".
  5. Нажмите "ОК" для сегментации или "Отмена" для отмены действия. Процесс занимает некоторое время.

После выполнения сегментации можно распределить ткани по бассейнам вручную с помощью маркеров сегментированных структур. Если нужные ткани не попали в структуру, необходимо установить на них маркеры, соответствующие структуре. Внимание! Изменения структур, сделанные с использованием маркеров, не могут быть отменены!

Чтобы сегментировать ткани методом водораздела с использованием маркеров, выполните следующие действия:

  1. Выделите структуру в списке.
  2. Активируйте инструмент "Маркер сегментированных структур", нажав на кнопку PIC на панели редактирования объёма левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
  3. Установите один или несколько маркеров в нужных местах щелчком кнопки мыши.
  4. При необходимости выполните эти действия с другими структурами.
  5. Нажмите на кнопку "Сегментация методом водораздела" PIC .
  6. Убедитесь, что установлен флаг "Использовать маркеры сегментированной структуры".
  7. Выберите из выпадающего списка "Источник" структуру, на основе которой необходимо выполнить сегментацию.
  8. Чтобы запомнить эту структуру как источник по умолчанию, установите флаг "Запомнить выбранную структуру".
  9. Чтобы отключить видимость исходной структуры, установите флаг "Скрыть исходную структуру".
  10. Чтобы отключить видимость не изменившихся после выполнения сегментации структур, установите флаг "Скрыть другие структуры".
  11. Нажмите "ОК" для сегментации или "Отмена" для отмены действия. Процесс занимает некоторое время.

Если маркеры разных структур поставлены в один бассейн, то сегментация завершается ошибкой.

Исходная структура не модифицируется. Структуры, не имеющие маркеров, не модифицируются.

Чтобы скрыть/отобразить маркеры для выбранной стуктуры, нажмите на стрелку в правой части кнопки "Маркер сегментированных структур" PIC и выберите команду "Спрятать маркеры сегментированной структуры" или "Показать маркеры сегменитрованной структуры" соответственно. Выбранная команда отмечана флагом. В остальном работа с маркерами аналогична описанной в разделе 5.7.

Если сегментация выпоняется для объединённой серии, то отображаются маркеры только для выбранного слоя. Маркеры доступны для редактирования независимо от того, какая структура выделена.

6.4.6 Инструмент "Многосегментный рост"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Данный инструмент применяется, когда необходимо нарастить несколько сегментированных структур так, чтобы они не пересеклись. Он подобен "Рост (дилатация)" (описан в разделе 3.7.7), однако может быть примнён одновременно к произвольному количеству структур а также к основному объёму. Чтобы воспользоваться инструментом, выполните следующие действия:

  1. Постройте необходимое количество сегментированных структур, которые требуется нарастить без пересечения.
  2. Активируйте инструмент "Многосегментный рост" PIC (подробнее в разделе 3.7.7). Откроется диалог, изображённый на рис. 6.11.
  3. В диалоге флагом отмечена выбранная в данный момент структура (основной объём). Отметьте флагами все структуры (основной объём), которые необходимо одновременно нарастить. Если отмечена только одна структура (объём), то инструмент работает аналогично инструменту "Рост (дилатация)".
  4. Установите максимальную величину наращивания в миллиметрах в поле "Радиус роста (мм)".
  5. Нажмите "ОК", чтобы выполнить наращивание, или "Отмена" для отмены действия. Процесс занимает некоторое время. Если наращивание выполнено не полностью, повторите шаги 2-4.
  6. Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC для каждой структуры (объёма), для которых выполнялось наращивание.



6.4.7 Инструмент "Рост регионов сегментированных структур"

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна только в 64-разрядной сборке программы.

Данный инструмент применяется, когда необходимо за одну итерацию нарастить несколько сегментированных структур (в том числе в пределах маски) так, чтобы они не пересеклись. Для использования инструмента необходима хотя бы одна непустая структура.

Чтобы воспользоваться инструментом, выполните следующие действия:

  1. Нажмите на кнопку "Рост регионов сегментированных структур" PIC . Открывается диалог, изображённый на рис. 6.12.
  2. В диалоге выберите структуры, которые необходимо нарастить.
  3. При необходимости выберите в качестве маски структуру или основной объём. Выбрать одну структуру и для наращивания, и в качестве маски невозможно.
  4. Нажмите "ОК", чтобы выполнить наращивание, или "Отмена" для отмены действия. Процесс занимает некоторое время.

Чтобы отменить действие, нажмите на кнопку "Отменить" PIC , чтобы повторить отменённое действие — на кнопку "Вернуть" PIC .



Во вкладке просмотра объёмной реконструкции рост структуры выполняется в пределах цветовой таблицы, установленной для этой структуры, в окне просмотра мультипланарной реконструкции — в пределах маски зелёного цвета.

Скорость роста находится в экспоненциальной зависимости от расстояния до границ маски, в пределах которой происходит наращивание. Это позволяет эффективно разделять области, связанные тонкими перемычками.