Содержание

Инобитек DICOM-Просмотрщик

5.19. Режим просмотра диффузионной спектральной томографии (DTI)

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции «Pro»
____________________________________________________________________________________________

Результаты трактографии не могут быть использованы для постановки диагноза

DICOM-Просмотрщик позволяет выполнять трактографию для серий, снятых в режиме DTI. На рис. 5.21 изображены кривые, являющиеся результатом трактографии нервных волокон головного мозга.

Рис. 5.21: Результат трактографии нервных волокон головного мозга

Кривые, построенные в результате трактографии, в интерфейсе программы и далее в руководстве пользователя называются волокнами.

5.19.1 Открытие серии в режиме DTI

Для серии, снятой в режиме DTI, трактография выполняется автоматически после открытия в режиме МПР. Изображения волокон можно наложить на изображения других серии этого же исследования, снятых не в DTI-режиме. Для этого выполните следующие действия:

Откройте серию, снятую не в DTI-режиме.
Нажмите на кнопку «DTI» на панели инструментов.
В открывшемся окне выберите серию, снятую в DTI-режиме.
Нажмите «Выбрать», чтобы наложить волокна из выбранной серии на открытую серию, или «Отмена» для отмены действия.

5.19.2 Выбор отображаемых волокон

Если необходимо сделать видимыми только часть волокон, нужно указать области, через которые проходят интересующие волокна, либо наоборот, волокна, которые нужно сделать невидимыми. Для этого используются инструменты группы ROI, расположенные на панели «Волокна». Работа с ними аналогична описанной в разделе 2.15.6. Обратите внимание, что инструменты ROI, расположенные на панели инструментов в верхней части окна, не могут быть использованы для настройки видимости волокон.

Чтобы сделать видимыми только часть волокон, выполните следующие действия:

Откройте серию, снятую в DTI-режиме, либо наложите волокна на обычную серию.
Выберите проекцию и срез, на котором удобно выделить область, через которую проходят интересующие волокна.
Откройте панель сегментации, нажав на кнопку «Панель сегментации» . В нижней части панели отобразится панель «Волокна» (рис. 5.22).
Выделите нужную область с помощью инструментов ROI («Прямоугольник» , «Эллипс» , «Полигон» ) на панели «Волокна». Аналогичные инструменты, расположенные на панели инструментов в верхней части окна, для этих целей не применяются. После построения ROI видимыми останутся только волокна, проходящие через область, ограниченную ROI. При создании первого ROI для него автоматически создаётся группа. Новые ROI добавляются в эту же группу.
Чтобы переименовать группу или ROI, дважды щёлкните левой кнопкой мыши по названию группы или ROI, введите новое название и нажмите на клавишу «Enter» на клавиатуре.
Для удаления группы или ROI выделите его и нажмите на кнопку «Удалить ROI» на панели «Волокна».
Если необходимо сделать невидимыми волокна, проходящие через выделенную область, установите флаг «Инверсия» для этого ROI.
Чтобы скрыть ROI, установите флаг «Скрыть ROI» для этого ROI (обозначен цифрой «1» на рис. 5.23). Чтобы скрыть все ROI, входящие в группу, установите этот флаг для группы (обозначен цифрой «2» на рис. 5.23). Чтобы скрыть все ROI, установите этот флаг в заголовке таблицы (обозначен цифрой «3» на рис. 5.23). Видимость ROI не влияет на видимость волокон.
Создавайте дополнительные ROI до тех пор, пока на экране не останутся только нужные волокна. На экране отображаются только волокна, которые проходят через все области, отмеченные с помощью ROI (либо не проходящие в случае инверсии).

Рис. 5.22: Панель «Волокна»

Рис. 5.23: Настройка видимости ROI

Флаг, находящийся слева от названия группы ROI и группы «Все волокна», отвечает за отображение соответствующих волокон. Если флаг установлен, то волокна отображаются. Данный флаг не влияет на настройки видимости волокон, он лишь позволяет временно скрыть их, например, для настройки видимости других групп волокон.

Чтобы сделать видимыми другие волокна, не изменяя видимость уже отображённых волокон, выполните следующие действия:

При необходимости скройте уже отображённые волокна, сняв флаг слева от названия группы волокон.
Отобразите все волокна, установив флаг слева от группы «Все волокна».
Добавьте новую группу, нажав на кнопку «Новая группа волокон» на панели «Волокна».
Постройте необходимое количество ROI для настройки видимости нужных волокон. Обратите внимание, что для того, чтобы ROI попадали в нужную группу, эта группа должна быть выделена в момент построения ROI.
При необходимости отобразите волокна других групп, установив флаг слева от названия групп.

Чтобы перейти к срезу, на котором находится определённый ROI, выделите этот ROI в списке и нажмите на кнопку «Перейти к ROI» на панели «Волокна».

5.19.3 Цвет волокон

По умолчанию волокна раскрашены в соответствии со схемой DEC (Direction Encoded Color - цвет, закодированный по направлению), то есть, цвет зависит от направления волокон. Для каждой группы волокон вручную может быть установлен свой цвет. На панели «Волокна» цвет обозначен значком в режиме DEC, а при ручном выборе — значком соответствующего цвета.

Чтобы вручную установить цвет для группы волокон, снимите флаг «DEC» для нужной группы, щёлкните два раза левой кнопкой мыши по значку цвета и в открывшемся диалоговом окне выберите нужный цвет либо оставьте цвет, выбранный программой по умолчанию.

Чтобы снова переключиться на схему DEC, установите флаг «DEC».

5.19.4 Скалярные карты

DICOM-Просмотрщик позволяет строить скалярные карты для серий, снятых в режиме DTI. Доступны следующие типы карт:

Fractional Anisotropy (FA);
Mean Diﬀusivity (MD);
Axial Diﬀusivity (AD);
Radial Diﬀusivity (RD).

По умолчанию карты не отображаются. Чтобы отобразить карту, выберите в выпадающем списке «Тип скалярной карты» нужную карту (рис. 5.24). Чтобы скрыть карту, выберите в списке пустое значение.

Рис. 5.24: Выбор скалярной карты

5.19.5 Построение поверхности

DICOM-Просмотрщик позволяет строить объёмные поверхности волокон в окне мультипланарной реконструкции.

Выделите группу волокон или ROI, входящий в выбранную группу волокон. Полигональная сетка строится для группы волокон. Изменение видимости ROI в группе волокон не влияет на построенную поверхность.

Каждому волокну соответствует объёмная фигура цилиндрической формы. Полигональная поверхность строится на основе диаметра цилиндра и количества точек на окружности цилиндра.

Чтобы настроить параметры поверхности сеточной модели, нажмите на кнопку «Создать полигональную сетку для волокон» на панели «Волокна». В диалоговом окне ввода параметров сеточной модели (рис. 5.25) задайте:

Число точек контура волокон в диапазоне от 3 до 360. В большинстве случаев для высокой точности достаточно 6 точек. При увеличении количества точек прямо пропорционально увеличивается точность модели, время расчёта и количество используемой памяти;
Диаметр волокон в диапазоне от 0,01 до 10 мм.

Рис. 5.25: Диалог ввода параметров параметров сеточной модели

Нажмите «OK», чтобы применить настройки, или «Отмена» для отмены.

Поверхность строится для выбранной группы волокон и добавляется в список на панели сегментированных структур. Имя поверхности, как и любой структуры без объёмной модели, отображается курсивом. Имя поверхности копируется из названия группы на панели волокон.

В режиме мультипланарной реконструкции доступен просмотр построенной поверхности. Чтобы открыть объёмную реконструкцию, нажмите на кнопку «3D» на панели инструментов. Объёмная реконструкция открывается в правом нижнем окне.

Действия со структурами в списке сегментированных структур описаны в разделе 6.9. Созданные поверхности могут быть экспортированы и импортированы. Подробное описание экспорта и импорта поверхностей и структур в разделе 6.10. Сохранение и открытие проектов сегментации и DTI описано в разделе 6.11.

5.19.6 Создание воксельной модели волокон

DICOM-Просмотрщик позволяет строить воксельные модели волокон в окне мультипланарной реконструкции.

Выделите группу волокон или ROI, входящий в выбранную группу волокон. Воксельная модель строится для группы волокон. Изменение видимости ROI в группе волокон не влияет на построенную модель.

Чтобы построить воксельную модель, нажмите на кнопку «Вокселизировать волокна» на панели «Волокна».

Воксельная модель строится для выбранной группы волокон и добавляется в список на панели сегментированных структур. Имя структуры копируется из названия группы на панели волокон.

Чтобы построить воксельную модель на основе всех волокон, выделите группу «Все волокна» и нажмите на кнопку «Вокселизировать волокна» на панели «Волокна».

Воксельная модель строится для выбранной группы волокон «Все волокна» и добавляется в список на панели сегментированных структур с именем «DTI-трактография».

В режиме мультипланарной реконструкции доступен просмотр построенной воксельной модели. Чтобы открыть объёмную реконструкцию, нажмите на кнопку «3D» на панели инструментов. Объёмная реконструкция открывается в правом нижнем окне.

5.19.7 Сохранение данных в файл

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в дополнительном модуле, который активируется в редакции «Pro» за отдельную плату
____________________________________________________________________________________________

DICOM-Просмотрщик позволяет сохранять ROI и группы в файл с расширением «spj». Сохранение и открытие файлов описано в разделе 6.11. При открытии файла содержащиеся в нём данные добавляются к данным на панели «Волокна».